فتح‌اله امی، رئیس پژوهشگاه هوافضا در مصاحبه با پایگاه خبری فضایی اسپاش اخبار منتشر شده در خصوص بودجه ۲۷۰ هزار میلیون ریالی (۲۷ میلیارد تومانی ) این پژوهشگاه در سال ۱۳۹۵ را به شدت تکذیب کرد و اظهار داشت طی سال ۹۵ تنها ۳۹ میلیارد ریال (۳.۹ میلیارد تومان) به این پژوهشگاه اختصاص یافت که این مبلغ هزینه حقوق پرسنل و اجرای پروژه‌های پژوهشگاه گردید.
چندی پیش در محافل هوافضایی به استناد خبری از خبرگزاری اعتدال انتقادات وسیعی به عملکرد پژوهشگاه هوافضای وزارت علوم شد. طی خبر منتشر شده در ۸ شهریور ۱۳۹۶ خرگزاری اعتدال تحت عنوان «اجرای 5 پروژه فضایی و تولید 13 داروی جدید» که با عنوانی دیگر در پایگاه خبری اسپاش نیز بازنشر شد اعلام شده است که «رشد اعتباری قابل توجهی که برای این پژوهشگاه در سال 1395 رقم خورد، بودجه این پژوهشگاه را از 13,068 میلیون ریال (1.3 میلیارد تومان) در سال 1394 به 275,758 میلیون ریال (27.5 میلیارد تومان) با رشد بی‌سابقه 2,010 درصدی افزایش داد و این اعتبار به میزان 100 درصد تخصیص یافت.» این مطلب به تازگی در محافل هوافضایی مجددا نقل شده و از خروجی کم این پژوهشگاه در برابر بودجه نجومی انتقاد می‌شود. این در حالی‌است که فتح اله امی، رئیس پژوهشگاه هوافضا در مصاحبه با پایگاه خبری فضایی اسپاش این خبر را کذب دانست و اظهار داشت طی سال ۹۵ تنها ۳۹ میلیارد ریال (۳.۹ میلیارد تومان) به این پژوهشگاه اختصاص یافت که این مبلغ هزینه حقوق پرسنل و اجرای پروژه‌های پژوهشگاه گردید.